生物序列分析與高通量技術
Sequencing technology and high-throughput data analysis
學期
106-1
學分
3
學分
當期課號
5732
永久課號
IBI7018
開課單位
生物資訊及系統生物研究所
授課教師
中研院國際學程
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週五 |
|---|---|
6 14:20–15:10 | 生物序列分析與高通量技術 3 節連堂 |
7 15:30–16:20 | |
8 16:30–17:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
Design and analysis of algorithms for biologists
先修科目
Please refer to the following website for details: http://tigpbp.iis.sinica.edu.tw/tigpbio/2016Fall.html#C
教學方式
TA: Chi-Chun Chen 陳奇君 Email: chichunchen@iis.sinica.edu.tw
評分方式
Midterm exam 50%. Final exam 50%.
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Analysis of Algorithms |
| 第 2 週 | Recurrence |
| 第 3 週 | Introduction to Data Structure (I) |
| 第 4 週 | Introduction to Data Structure (II) |
| 第 5 週 | Algorithmic Techniques |
| 第 6 週 | Motif Finding |
| 第 7 週 | Graph Algorithms |
| 第 8 週 | Review Week |
| 第 9 週 | Midterm Exam |
| 第 10 週 | Sequence Alignment (I) |
| 第 11 週 | Sequence Alignment (II) |
| 第 12 週 | Combinatorial Pattern Matching |
| 第 13 週 | Suffix Trees |
| 第 14 週 | The Analysis of Next Generation Sequencing Data(I) |
| 第 15 週 | The Analysis of Next Generation Sequencing Data (II) |
| 第 16 週 | Fundamentals of Molecular Evolution and Phylogenetic Tree Construction |
| 第 17 週 | Review Week |
| 第 18 週 | Final Exam |
教科書
N/A
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