次世代資料之應用
NGS Data Applications
學期
106-2
學分
2
學分
當期課號
B479
永久課號
A9378
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
林振慶、鍾翊方、黃彥華
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週四 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 次世代資料之應用 YR103 2 節連堂 |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction |
| 第 2 週 | RNA-Seq data (I): Expression, Alternative splicing & Novel genes |
| 第 3 週 | RNA-Seq data (II): RNA editing |
| 第 4 週 | RNA-Seq data (III): Fusion genes |
| 第 5 週 | Exome-Seq data (I): Prediction of mutation effect |
| 第 6 週 | Exome-Seq data (II): Mutation hotspots & Cancer driver genes |
| 第 7 週 | 清明節 |
| 第 8 週 | Introduction to the third generation sequencing: PacBio |
| 第 9 週 | Whole genome-Seq data (I): Assembly |
| 第 10 週 | Whole genome-Seq data (II): Annotation & Repetitive elements |
| 第 11 週 | Whole genome-Seq data (III): Multiple locus typing (MLST) |
| 第 12 週 | Whole genome assembly of PacBio reads |
| 第 13 週 | Sequencing error correction (I) |
| 第 14 週 | Sequencing error correction (II) |
| 第 15 週 | Network Biology (I) |
| 第 16 週 | Network Biology (II) |
| 第 17 週 | Network Biology (III) |
| 第 18 週 | Final project presentation |