結合臨床資料及二代定序基因分析-提升學生實際操作及大數據分析能力
Combining clinical data with next generation sequencing (NGS) gene analysis - improving students’ practical operations and big data analysis capabilities
學期
107-1
學分
2
學分
當期課號
A012
永久課號
B0963
開課單位
教務處
授課教師
劉孜孜、張世慶、林明薇、楊佳鳳
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週一 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 結合臨床資料及二代定序基因分析-提升學生實際操作及大數據分析能力 YS419 2 節連堂 |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | 課程規則介紹、遺傳學簡介(1) |
| 第 2 週 | 遺傳學簡介(2) |
| 第 3 週 | |
| 第 4 週 | 遺傳性大腸直腸癌 |
| 第 5 週 | 基因體資料及其相關應用 |
| 第 6 週 | 時間改到 10/19 第 7、8 節,遺傳性代謝疾病 |
| 第 7 週 | 次世代定序的原理(Illumina) Application of Precision Medicine in Cancer Management |
| 第 8 週 | Probe 設計及各種 Library 設計 軟體介紹 CLC Genomics Workbench |
| 第 9 週 | 軟體介紹 CLC Genomics Workbench 各種軟體介紹及指令介紹 |
| 第 10 週 | 期中考(open book) |
| 第 11 週 | 上機,分組參觀 (每組 4-5 人)at 基因體中心 Probe 設計及各種 Library 設計 |
| 第 12 週 | 各種軟體介紹及指令介紹 上機,分組參觀 (每組 4-5 人)at 基因體中心 |
| 第 13 週 | Whole Genome NGS Analysis and Demonstration, Target Genes NGS Demonstration |
| 第 14 週 | 資料分析實作–軟體安裝與定序檔案前處理 |
| 第 15 週 | 資料分析實作–雲端定序分析與變異檢測 |
| 第 16 週 | 資料分析實作–變異註解與視覺化檢視 |
| 第 17 週 | |
| 第 18 週 | 臨床資料和 NGS 連結及討論 期末考(open book) |