整合性基因體資料庫之應用程式設計
Ensembl API programming
學期
108-1
學分
1
學分
當期課號
B442
永久課號
B1292
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
黃彥華
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週五 |
|---|---|
3 10:10–11:00 | 整合性基因體資料庫之應用程式設計 YR102 2 節連堂 |
4 11:10–12:00 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction to Ensembl DB and browser families |
| 第 2 週 | Introduction to Ensembl DB and browser familiesRevisit of GenBank file format (1) |
| 第 3 週 | Revisit of GenBank file format (1)Revisit of GenBank file format (2) |
| 第 4 週 | Revisit of GenBank file format (2)Ensembl virtual machine |
| 第 5 週 | 國慶日連假 |
| 第 6 週 | Ensembl virtual machineMySQL and Ensembl Perl APIs |
| 第 7 週 | MySQL and Ensembl Perl APIsEnsembl RESTful APIs, R, and Python |
| 第 8 週 | Ensembl RESTful APIs, R, and PythonPyEnsembl (1) |
| 第 9 週 | PyEnsembl (1)PyEnsembl (2) |
| 第 10 週 | PyEnsembl (2)Final report and discussion |
| 第 11 週 | Final report and discussion |
| 第 12 週 | |
| 第 13 週 | |
| 第 14 週 | |
| 第 15 週 | |
| 第 16 週 | |
| 第 17 週 | |
| 第 18 週 |