轉譯基因體
Translational genomics
學期
109-2
學分
2
學分
當期課號
B831
永久課號
B0563
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
鍾翊方、黃彥華
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週二 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 轉譯基因體 YR105 2 節連堂 |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
NGS data preprocessing, RNA-seq and sRNA-seq analysis, finding differentially expressed genes, differentially regulated pathways
教學方式
使學生將次世代定序技術,以及其數據分析,應用於生醫轉譯研究1. data analysis of next-generation sequencing data 2. application of NGS data analysis to translational studies
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction |
| 第 2 週 | Previous analysis pipeline and results -1 |
| 第 3 週 | Previous analysis pipeline and results -2 |
| 第 4 週 | NGS data pre-processing -1 |
| 第 5 週 | NGS data pre-processing -2 |
| 第 6 週 | CLUE - 1 |
| 第 7 週 | CLUE - 2 |
| 第 8 週 | IPA |
| 第 9 週 | deep learning 1 |
| 第 10 週 | deep learning 2 |
| 第 11 週 | RNA-seq -1 |
| 第 12 週 | RNA-seq -2 |
| 第 13 週 | RNA-seq -3 |
| 第 14 週 | sRNA-seq -1 |
| 第 15 週 | sRNA-seq -2 |
| 第 16 週 | sRNA-seq -3 |
| 第 17 週 | Cell subtyping -1 |
| 第 18 週 | Cell subtyping -2 |
教科書
自編講義