合成生物學
Synthetic Biology
學期
110-1
學分
2
學分
當期課號
B070
永久課號
A1749
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
張傳雄
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週二 |
|---|---|
A 18:30–19:20 | 合成生物學 YR104 2 節連堂 |
B 19:30–20:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
本課程由淺入深,基於理論設計與實際操作之結合,將合成生物學分為下列三個部份引領學生明瞭該領域之緣起、基礎,與最新之發展 1. 合成生物學之組合零件與方法: - The Registry of Standard Biological Parts - Standardization, Abstraction & Modularity - Parts Assembly and Codon Optimization 2. 合成生物學系統之建立與模擬: - Functional Organization of Genetic Circuits - Expression and Cloning Systems - Modeling and Simulation 3. 合成生物學系統之工程技術: - Chassis Selction and Characterization - Basic Engineering Techniques (I) - Basic Engineering Techniques (II)
教學方式
合成生物學以正向工程的方法探究與測試生物運作機制,並結合工程,電腦設計模擬與生物實作,以各式創意開發新的應用。
評分方式
Final Report
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction to synthetic biology |
| 第 2 週 | Genetic engineering & recombinant DNA techniques |
| 第 3 週 | Methods to measure biological interactions |
| 第 4 週 | Bioparts: characterization & assembly |
| 第 5 週 | Design and construction of genetic circuits: device & system |
| 第 6 週 | Genetic toggle switch: from Repressilator to Oscillator |
| 第 7 週 | Modeling and Simulation I |
| 第 8 週 | Modeling and Simulation II |
| 第 9 週 | Promoter design and engineering |
| 第 10 週 | RNA synthetic biology |
| 第 11 週 | Protein design and engineering |
| 第 12 週 | Pathway design and engineering I |
| 第 13 週 | Pathway design and engineering II |
| 第 14 週 | Computer-aided genome design I |
| 第 15 週 | Computer-aided genome design II |
| 第 16 週 | Synthetic and combinatorial genomics |
| 第 17 週 | Group discussion |
| 第 18 週 | Final Report |