合成生物學實作
Synthetic Biology In Practice
學期
110-2
學分
2
學分
當期課號
D297
永久課號
A1752
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
張傳雄
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週四 |
|---|---|
B 19:30–20:20 | 合成生物學實作 YR105 2 節連堂 |
C 20:30–21:20 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
將合成生物學分為下列三個部份引領學生實際明瞭該領域之緣起、基礎,與最新之發展技術: 1. 合成生物學之組合零件與方法 2. 合成生物學系統之建立與模擬 3. 合成生物學系統之工程實作
教學方式
合成生物學以正向工程的方法探究與測試生物運作機制,並結合工程,電腦設計模擬與生物實作,以各式創意開發新的應用。本課程由淺入深,基於理論設計與實際操作之結合.
評分方式
期末報告: 100%
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Synthetic Biology in Practice: Introduction & Overview |
| 第 2 週 | Standardization, Abstraction, and Modularity |
| 第 3 週 | Parts Registry and Biobricks |
| 第 4 週 | In silico Biobrick Assembly |
| 第 5 週 | Engineering Techniques and Rules |
| 第 6 週 | Parts Design and Amplification (I) |
| 第 7 週 | Parts Design and Amplification (II) |
| 第 8 週 | Midterm Report and Discussion |
| 第 9 週 | In silico Gene Design |
| 第 10 週 | In silico Pathway Design |
| 第 11 週 | Genetic Circuit Construction |
| 第 12 週 | Genetic Circuit Modeling |
| 第 13 週 | Genetic Circuit Simulation |
| 第 14 週 | Integrated Genetic Circuit Design (I) |
| 第 15 週 | Integrated Genetic Circuit Design (II) |
| 第 16 週 | Control of Circuit Constructs |
| 第 17 週 | Circuit Construct validation |
| 第 18 週 | Final Report and Discussion |
教科書
Reference books (not required): Cell-Free Synthetic Biology Platform for Engineering Synthetic Biological Circuits and Systems (2019) Synthetic Metabolic Pathways - Methods and Protocols (2018) BioBuilder - Synthetic Biology in the Lab (2015) Whole-cell modeling for synthetic biology (2013) Synthetic Biology, Part B - Computer-Aided Design and DNA Assembly (2011) Synthetic Biology - Methods for Part Device Characterization and Chassis Engineering (2011)