轉譯基因體
Translational genomics
學期
110-2
學分
2
學分
當期課號
D301
永久課號
B0563
開課單位
生物醫學資訊研究所
授課教師
黃彥華
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週二 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 轉譯基因體 YR105 2 節連堂 |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
教學方式
使學生對於生醫轉譯研究中, 常用的大數據的資料來源及研究方法, 深入的認識: 1. Health data source and analysis 2. PyTorch framework 3. Taiwan Precision Medicine Initiative (TPMI) 4. Image analysis1. Health data source and analysis 2. PyTorch framework 3. Taiwan Precision Medicine Initiative (TPMI) 4. Image analysis
評分方式
課堂討論 - 40% 期末報告 - 60%discussion - 40% term report - 60%
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Introduction |
| 第 2 週 | PyTorch 1Previous analysis pipeline and results -1 |
| 第 3 週 | PyTorch 2Previous analysis pipeline and results -2 |
| 第 4 週 | Health data sourcesNGS data pre-processing -1 |
| 第 5 週 | Image classification - Grad-CAM, Grad-CAM++ 1NGS data pre-processing -2 |
| 第 6 週 | Image classification - Grad-CAM, Grad-CAM++ 2CLUE - 1 |
| 第 7 週 | Object detection CLUE - 2 |
| 第 8 週 | Graph convolution network (GCN) 1IPA |
| 第 9 週 | Graph convolution network (GCN) 2deep learning 1 |
| 第 10 週 | GWAS 1deep learning 2 |
| 第 11 週 | GWAS 2RNA-seq -1 |
| 第 12 週 | Image analysis 1RNA-seq -2 |
| 第 13 週 | Image analysis 2RNA-seq -3 |
| 第 14 週 | Image analysis 3sRNA-seq -1 |
| 第 15 週 | Image analysis 4sRNA-seq -2 |
| 第 16 週 | Multiple instance learningsRNA-seq -3 |
| 第 17 週 | Term discussion 1Cell subtyping -1 |
| 第 18 週 | Term discussion 2Cell subtyping -2 |
教科書
自編講義