基因體學
Comparative and Evolutionary Genomics
學期
111-2
學分
2
學分
當期課號
133023
永久課號
LSGS30007
開課單位
生命科學系暨基因體科學研究所
授課教師
陳瀅州、鍾明怡、可文亞、李敏嘉、袁維謙、陳儀聰
校區
陽明
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週四 |
|---|---|
5 13:20–14:10 | 基因體學 YC401 2 節連堂 |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
本課程範疇為廣義的"基因體學",除了 基因體、演化與比較基因體學、基因體醫學外,也包含轉錄體學、與系統生物學。課程內容包含理論基礎,與利用近期文獻之應用作為範例介紹.
先修科目
基礎生物學、基礎生物化學、基礎分子生物學、基礎遺傳學、基礎生物統計學、
評分方式
評量方式: 作業或紙筆測驗,由各授課教師決定。 比重依照授課時數比例分配:鍾明怡(8/15)、可文亞(4/15)、李敏嘉(4/15)、陳瀅州(6/15)、陳儀聰(6/15)、袁維謙(2/15)
課程大綱
- Genomics and genomic medicine
- Transcriptome
- Systems biology
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | Theme 1. Genomics and Genomic medicine Principles of genome sequencing projects (1) |
| 第 2 週 | Principles of genome sequencing projects (2) |
| 第 3 週 | Next-Generation Sequencing Techniques |
| 第 4 週 | Sequence alignment and genome annotation |
| 第 5 週 | Comparative Genomics |
| 第 6 週 | Evolutionary Genomics |
| 第 7 週 | 大 review 線上課程 Genomic medicine (1) |
| 第 8 週 | 校際活動週 |
| 第 9 週 | Genomic medicine (2) |
| 第 10 週 | Theme 2. Transcriptome Chap. 4: Gene expression analysis and the transcriptome. |
| 第 11 週 | Example (1) of transcriptome analysis-- lndRNA |
| 第 12 週 | Example (2) of transcriptome analysis-- miRNA |
| 第 13 週 | Example (3) of transcriptome analysis—single cell RNAseq |
| 第 14 週 | Theme 4. Systems Biology Systems Biology(1) |
| 第 15 週 | Systems Biology(2) |
| 第 16 週 | Systems Biology(3) |
| 第 17 週 | 期中考 |
| 第 18 週 | 期末考 |
教科書
教科書:Introduction to Genomics, 3rd ed., by Arthur Lesk, 2017 https://global.oup.com/ukhe/product/introduction-to-genomics-9780198754831?cc=tw&lang=en& 以及各授課教師指定之參考資料。
Office Hours
- 聯絡方式
- 鍾明怡(mychung@nycu.edu.tw)、可文亞(wenko@nycu.edu.tw )、李敏嘉(lee.mingchia@nycu.edu.tw)、陳瀅州(yjoechen@nycu.edu.tw)、 陳儀聰(yeitsungchen@nycu.edu.tw)、袁維謙(wcyuan@nycu.edu.tw)