計算機概論(二)
Introduction to Computer Science (2)
| 節 | 週二 | 週四 |
|---|---|---|
2 09:00–09:50 | 計算機概論(二) | |
5 13:20–14:10 | 計算機概論(二) 2 節連堂 | |
6 14:20–15:10 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
1. 繪製2D及3D化學分子結構 2. 初窺量子力學軟體:計算分子能量,分子軌域的波函數及量能相關物化特性 3. 使用JMOL及JavaScript語言將計算及畫圖結果放置在網路上 4. 繼續學習JavaScript語言,可以寫出更多好玩的網頁程式! ^^
必須熟悉HTML及JavaScript程式設計 必須對化學有趣 必須對JavaScript程式設計有趣
作業部份: 1.作業是在上課時習作,下課時請到E3將作上傳至作業繳交區 2.作業準時交者其滿分為100,截止時間過後就不用交了以0分計算。 考試部份: 期中考:使用 JavaScript 結合 JMOL JAVA軟體製作3D互動式化學資訊網頁 期末考:JavaScript程式設計 -- 2 評量部份: Homework (40%), 期中考 (30%), 及 期末考(30%)
- 化學結構繪圖篇
- 計算化學軟體篇:利用SPARTAN
- 學習 JavaScript 語言 -- 2
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | 利用BIOVIA Draw 繪製2D化學結構 - 2 hrs 作業 DS Visualizer 操作1:認識簡單有機分子3D結構-1 -- 2 hrs 作業 |
| 第 2 週 | DS Visualizer 操作1:認識簡單有機分子3D結構-2 -- 2 hrs 作業 DS Visualizer 操作2:認識環狀碳化合物分子結構 -- 2 hrs 作業 |
| 第 3 週 | DS Visualizer 操作3:認識生化分子及Octahedral 錯化合物 -- 3 hrs 作業 |
| 第 4 週 | Diamond 繪製金屬及鹽類結晶結構 -- 2 hrs JSmol 1 利用 JSmol 學習化學資訊並刊登化學結構於網頁上-1 (3hrs) 作業 |
| 第 5 週 | JSmol 1 利用 JSmol 學習化學資訊並刊登化學結構於網頁上-2 (3hrs) 作業 JSmol 2 認識MOL檔案類型:如何在Jsmol中選特定分子與原子團(2hrs) 作業 |
| 第 6 週 | JSmol 3 將PDB檔的蛋白質及DNA置入Jmol的互動網頁(2 hrs) 作業 JSmol 4 利用 Diamond 繪製CIF結晶分子並置入Jmol的互動網頁-1(2hrs) |
| 第 7 週 | JSmol 4 利用 Diamond 繪製CIF結晶分子並置入Jmol的互動網頁-2(2hrs) JSmol Mid 期中考總複習(考古題實作) -- 2hrs |
| 第 8 週 | 期中考 |
| 第 9 週 | JSmol 5 利用 spartan 繪製分子軌域(Molecular Orbital & Vibration Simulation)置入JSmol的互動網頁 -- 3hrs |
| 第 10 週 | JS-7 認識 Array 陣列 (3 hrs) 作業 |
| 第 11 週 | JS-8 認識 for loop的控制結構 (3 hrs) 作業 |
| 第 12 週 | JS-9 Nested Loop的控制結構 (3 hrs) 作業 |
| 第 13 週 | JS-10 如何利用JavaScript在JSmol任意擺放分子 -- 認識XYZ檔案類型 (3 hrs) |
| 第 14 週 | JS-11 如何利用JavaScript 讓分子在 JSmol 任意移(認識Molecular Dynamics MD Simulation) -- Nested Loop的應用 (3 hrs) |
| 第 15 週 | JavaScript2 期末考總複習(考古題練習) |
| 第 16 週 | 期末考 |
| 第 17 週 | |
| 第 18 週 |
無 參考書籍: 上課的PoerPoint講義 網路的資訊 參考資料 【Molecular Modelling】 1. Goodman, J. Chemical Applications of Molecular Modelling, RSC, 1998. 2. Rzepa, Whitaker and Winter, " Chemical Applications of the World-Wide-Web System" J. Chem. Soc., Chem. Commun.,1907 (1994) 3. Titan: Tutorial and user's guid, Wavefunction, California 1999. 4. Rapaport, D.C. The Art of Molecular Dynamics Simulation, 2nd ed. Cambridge University Press, New York 2003. 【JavaScript】 1. Reed D., A Balanced Introduction to Computer Science, Pearson Prentice Hall, New Jersy, 2005. 2. Quigley E.,, JavaScript by example, Prentice Hall, NJ, 2004. 3. 《 JavaScript設計風格》, Nick Heinle & Bill Pena著, 吳欣芸譯, O'Rrilly, 2002. 4. 《JavaScript最新網頁製作》, 施威銘研究室及風信子著, 旗標, 民89.
- 地點
- 科二館331教室
- 時間
- 星期三下午1:30~2:30
- 聯絡方式
- 分機:56584 twli@mail.nctu.edu.tw