結構生物學
Structural Biology
學期
113-2
學分
3
學分
當期課號
430025
永久課號
BTBT30130
開課單位
生物科技學系
授課教師
蕭育源
校區
博愛
類別
選修
上課時間表
| 節 | 週四 |
|---|---|
2 09:00–09:50 | 結構生物學 BI301 3 節連堂 |
3 10:10–11:00 | |
4 11:10–12:00 |
* 根據陽明交大上課時間表所列
概述
本課程之目的,是以結構生物學為基礎,更加深入的探討蛋白質的結構與功能的相關性;想讓學生能夠確實連結蛋白質結構與其功能。課程的最終目的是想讓學生培養出自己分析結構的能力,能夠根據蛋白質結構所提供資訊息,猜測出蛋白質的功能,並設計實驗去印證自己的假設。
先修科目
建議有生物化學或分子生物學基礎為佳。
教學方式
上課投影片及作業:投影片及作業會上網 (E3) 公布 此課程會導入科技輔助教學以及Team-based learning
評分方式
1學期作業 每次課程結束會依課程內容安排作業。 2.考試狀況 期中考 (只有一次筆試) 3.評量方法 作業與平時成績 20% 期中考(筆試) (Midterm Test) 40% 分組報告 (Group presentation) 40%
課程大綱
- 蛋白質結構與功能的相關理論
- 結構分析軟體操作
- 蛋白質結構相關的期刊之討論與報告
週次計畫
| 週次 | 主題 |
|---|---|
| 第 1 週 | 蛋白質的結構與功能課程簡介 |
| 第 2 週 | 蛋白質的基本構成-胺基酸pymol 介紹 |
| 第 3 週 | 蛋白質二、三級結構-1 (α-helices and α domain structure)實作 : pymol 練習 |
| 第 4 週 | 蛋白質二、三級結構-2 (β-sheets and β structure)實作 : pymol 練習 |
| 第 5 週 | 蛋白質二、三級結構-3 (turns, loops and α/β structure)實作 : pymol 練習 |
| 第 6 週 | 結構解析方法-1 實作 : pymol 練習 |
| 第 7 週 | 清明節假期 |
| 第 8 週 | 結構解析方法-2 實作 : pymol 練習 |
| 第 9 週 | 蛋白質的四級結構-1實作 : pymol 練習 |
| 第 10 週 | 蛋白質的四級結構-2實作 : pymol 練習 |
| 第 11 週 | 蛋白質的功能區-活性中心 (active site)與(binding site)結合位實作 : pymol 練習 |
| 第 12 週 | 結構的堆疊比較與模擬 (Structure alignment and homology model modeling)實作 : pymol 練習 |
| 第 13 週 | 蛋白質、核酸與轉錄因子實作 : pymol 練習 |
| 第 14 週 | 期中考 |
| 第 15 週 | 蛋白質結構在生物科技以及藥物設計的應用實作 : pymol 練習 |
| 第 16 週 | 期末報告 |
| 第 17 週 | 自主學習 |
| 第 18 週 | 自主學習 |
教科書
書名:Protein Structure and Function, Gregory A Petsko and Dagmar Ringe. (2008) ISBN: 9780199556847 書名:Introduction of Protein Structure, Carl Branden and John Tooze. (1998) ISBN: 0-8153-2305-0
Office Hours
- 地點
- 博愛校區 賢齊樓 425室
- 時間
- 星期一 17:30-20:00
- 聯絡方式
- 蕭育源 mike0617@nycu.edu.tw Tel:03-5712121-56999